Sief phân tử loại Y có cấu trúc lục giác đóng gói gần như kim cương. Nếu lồng beta được sử dụng làm đơn vị cấu trúc để thay thế các nút nguyên tử carbon của kim cương và hai lồng beta liền kề được kết nối với lồng cột hình lục giác, nghĩa là, năm lồng beta được kết nối cùng với bốn cột Cấu trúc được hình thành. Bằng cách tiếp tục liên kết với cấu trúc này, cấu trúc sàng phân tử loại Y thu được. Trong cấu trúc này, lồng lớn được hình thành bởi lồng và lồng cột lục giác là một lồng zeolite tám mặt, và các lỗ cửa sổ liên kết của chúng là mười hai vòng nhị phân, có kích thước lỗ rỗng hiệu quả trung bình là 0,74nm, đó là kích thước lỗ rỗng của khe phân tử kiểu Y. X rây phân tử x và cấu trúc sàng phân tử loại Y hoàn toàn giống nhau, nhưng tỷ lệ nhôm silica phân tử loại Y cao, ổn định thủy nhiệt mạnh, do đó nó được sử dụng rộng rãi hơn.
